9-12月m6A最新高分文章汇总-技术前沿-资讯-生物在线

m6A修饰是一种可逆的RNA修饰类型，也是目前RNA中研究*清楚的一种修饰方式。有关RNA m6A修饰*早的研究报道在1974年，随后在各物种中被发现，m6A修饰几乎在所有RNA代谢过程中发挥重要作用。目前针对m6A RNA甲基化的研究仍然如火如荼。
近几月，有关m6A RNA甲基化修饰的高分文章依旧层出不穷，多篇文章报道了m6A在各个研究方向的机制。那么有哪些具体的进展？有哪些新的方法思路？小编汇集了9月至今这三个多月的多篇m6A RNA修饰高分文章，带大家把握这一领域的*新进展。

m6A近期高分文章汇总

高分文章展示

1. m6A介导干扰素信号传导和抗原呈递
发表期刊：Cancer Discovery
影响因子：39.397
发表时间：2021.10.08
文章链接：Transcription Elongation Machinery Is a Druggable Dependency and Potentiates Immunotherapy in Glioblastoma Stem Cells
胶质母细胞瘤（GBM）是*具侵袭性和致命性的人类*症之一，由GBM干细胞（GSCs）促进。受遗传和表观遗传改变驱动的GSC有助于*瘤的持续生长、侵入正常大脑、逃避免疫监视和zhi疗抵抗，因此是GBMzhi疗的关键靶标。本文研究人员在大量患者来源的GSC、分化的胶质母细胞瘤细胞（DGC）和神经干细胞（NSC）中探究基因表达和全基因组CRISPR/Cas9筛选，以确定 GSC 干性的主要调节因子，揭示基本的转录状态随着 RNA 聚合酶 II 介导的转录增加。发现YY1 和转录 CDK9 复合物对于体外和体内 GSC 的存活和维持至关重要，可调节 GSC 中的转录延伸，并靶向引发 RNA m6A 修饰依赖性干扰素反应，减少调节性 T 细胞浸润，并增强免疫检查点zhi疗在胶质母细胞瘤中的疗效。总的来说，YY1-CDK9 转录延伸复合物定义了一种可靶向的细胞状态，在胶质母细胞瘤中具有活跃的转录、抑制的干扰素反应和免疫zhi疗抗性。

图例：YY1-CDK9复合物通过调节RNA 聚合酶 II介导的转录延伸和RNA m6A修饰

2. 对RNA修饰测序进行系统校准的方法
发表期刊：Nature Methods
影响因子：28.547
发表时间：2021.09.30
文章链接：Systematic calibration of epitranscriptomic maps using a synthetic modification-free RNA library
在转录组中普遍存在的RNA修饰的发现导致了表观转录组学领域的快速发展。近年来，研究人员们设计了多种方法来揭示不同RNA修饰的表观转录组图谱。但是在实际应用中，效果差强人意，经常存在高假阳性率、低分辨率的问题。不同研究方法下，同一种修饰的位点数甚至能相差2-3个数量级。因此，需要开发一种充分可靠的方法，作为评估表观转录图谱的标准。因此，中山大学的骆观正教授团队提出了一种体外构建全转录组无修饰RNA（IVT RNA）文库的方法，系统地对常用的RNA修饰检测方法进行评估和校正，提高了修饰位点检测的准确性，从而获得高置信度位点信息和定量图谱。

图例：IVT RNA文库校正MeRIP-seq/m6A-seq

3. m6A-seq2方法实现m6A定量分析
发表期刊：Nature Methods
影响因子：28.547
发表时间：2021.09.03
文章链接：Multiplexed profiling facilitates robust m6A quantification at site, gene and sample resolution
常用的基于抗体识别m6A的鉴定RNA m6A修饰位点的m6A-seq法，存在一些明显的缺点：（1）RNA用量大；（2）生物学重复差；（3）无法进行样本和基因层面的定量分析；（4）实验成本高。基于这些不足，研究人员针对其进行优化升级，开发了m6A-seq2：对不同样本进行标签化——通过对不同样本连接特异性的接头，混合后进行抗体识别与免疫沉淀与建库，**降低每个样本RNA的用量，并且由于是同时进行免疫沉淀和建库，生物学重复性也会明显提高，同时也会**降低实验成本。

图例：m6A-seq与m6A-seq2实验方法的示意图比较

4. IGF2BP维持造血干细胞功能
发表期刊：Cell Stem Cell
影响因子：24.633
发表时间：2021.10.21
文章链接：Differential m6A RNA landscapes across hematopoiesis reveal a role for IGF2BP2 in preserving hematopoietic stem cell function
m6A是mRNA上*丰富的修饰，在各种生物过程中起着关键作用，一些m6A调节因子在正常和恶性造血过程中起关键作用，调节星状细胞命运。因此，建立RNA m6A修饰的全mian景观，解读其在不同生理和病理背景下的动态和作用至关重要。然而由于稀少细胞的技术限制，造血系统中的m6A景观仍是未知状态。因此，研究人员开发了一种针对稀少的造血干细胞的高度敏感和高效的zhong共输入m6A测序（SLIM-seq）策略，建立了一个跨造血层次的全mianm6A景观，并发现IGF2BP2是通过调节线粒体活性维持星状细胞功能的关键因子。

图例：造血系统m6A景观及IGF2BP2作用机制

5. FTO缓解心功能障碍
发表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy
影响因子：18.187
发表时间：2021.11.02
文章链接：m6A demethylase FTO attenuates cardiac dysfunction by regulating glucose uptake and glycolysis in mice with pressure overload-induced heart failure
m6A参与多种生物过程和疾病，是哺乳动物mRNA*常见的转录后修饰。然而它在心力衰竭（HF）期间心脏功能代谢变化中的作用尚不清楚。为此，研究人员探究了m6A去甲基化酶基因 FTO 在压力过载诱导的心衰期间的代谢中的作用。该研究jing准报道了该基因在心脏功能发挥和结构重塑中的关键功能，特别是作用于葡萄糖代谢途径，揭示了m6A修饰在 HF 期间心脏代谢稳态中作用，表明 FTO 有潜力成为 HF 预防和zhi疗靶点。

图例：FTO调节葡萄糖摄取和糖酵解的模型

6. m6A促进阿尔兹海默症发展
发表期刊：Molecular Cell
影响因子：17.970
发表时间：2021.10.21
文章链接：Interaction of tau with HNRNPA2B1 and N6-methyladenosine RNA mediates the progression of tauopathy
微管相关蛋白tau在健康状态下能够稳定微管，但是在压力和疾病下，如阿尔兹海默症（AD），会发生寡聚、磷酸化，在躯体树突枝中积累。Tau蛋白在应激和疾病状态下的生物学功能仍是未知状态。研究人员发现tau蛋白的低聚化会招募RNA结合蛋白和m6A修饰的RNA转录本，称为N6-甲基腺苷RNA。这种复合物调节应激反应并抑制蛋白质的合成。在AD及其相关模型中，这种复合物变得持续化和病理化，导致tau蛋白纤维化、核膜破坏和进行性神经衰退性变。HNRNPA2B1下调可降低对病理tau蛋白的反应。m6A随着人类AD大脑中疾病的严重程度逐渐增加。

图例：m6A与寡聚tau蛋白在人AD脑组织first定位

7. m6A reader IMP2或发挥促结直肠*作用
发表期刊：Journal of Hematology and Oncology
影响因子：17.388
发表时间：2021.11.07
文章链接：N6-methyladenosine reader IMP2 stabilizes the ZFAS1/OLA1 axis and activates the Warburg efect: implication in colorectal cancer
越来越多的证据表明m6A调节器参与到结直肠*（CRC）的病因学和进展，但是m6A reader参与糖酵解代谢的确切机制尚未清楚。本文研究人员发现，在CRC中，lncRNA ZFAS1的RGGAC/RRACH元件的+843腺苷位点发生m6A修饰，IMP2与其直接互作，促进ZFS1的RNA稳定，在CRC增殖和进展过程中增加OLA1的招募、ATP的水解以及糖酵解。IMP2和ZFAS1在CRC细胞和配对CRC队列中明显过表达，m6A水平升高（n=144），这些指标可以是CRC预后预测的chao低生物标志物。IMP2调控ZFAS1表达，增强CRC细胞增殖、集落形成和凋亡抑制，具有致*作用。

图例：IMP2稳定的ZFAS1通过促进OLA1的ATP酶活性来促进结直肠*进展

云序生物m6A修饰研究五大模块

01 m6A RNA修饰测序
m6A RNA修饰测序（m6A-meRIP-seq）
对m6A RNA甲基化，目前*流行的检测手段为m6A-MeRIP-Seq技术，适用于m6A RNA甲基化谱研究，快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m6A测序：

m6A 全转录组测序（涵盖mRNA，LncRNA，circRNA）
m6A LncRNA测序（涵盖LncRNA和mRNA）
m6A Pri-miRNA测序（涵盖Pri-miRNA和mRNA）
m6A mRNA测序
m6A miRNA测序

02 检测整体m6A RNA修饰水平
LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平
*高高效，可以实现一次检测，9类修饰水平检测，一步到位。
比色法检测整体RNA修饰水平
快速检测m6A整体甲基化水平
03 m6A RNA修饰上游酶的筛选
m6A RNA修饰相关酶PCR芯片
寻找上游直接调控m6A RNA甲基化的甲基转移酶。
04 m6A RNA修饰靶基因验证
MeRIP-qPCR
云序提供各类不同修饰的meRIP-qPCR服务，可针对mRNA，lncRNA，环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测，低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。
05机制互作研究
5.1 RIP-seq/qPCR
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控机制。
5.2 RNA pull down -MS/WB
筛选或验证目标RNA互作基因或蛋白，研究相应的分子调控机制。
5.3 双荧光素酶实验
验证两基因互作，研究相应的分子调控机制。
5.4ChIP-seq
筛选或验证目标蛋白与DNA互作，研究相应的分子调控机制。

云序生物服务优势

优势一：发表10分以上文章*多的m6A RNA甲基化测序服务平台。云序已累计支持客户发表52+篇高水平文章，合计影响因子450分+，是国内支持发文*多、累计影响因子*高的公司。
优势二：至今完成4000+例 m6A测序样本，全mian覆盖医口、农口等各类样本。
优势三：全mian检测mRNA和各类非编码RNA（circRNA，lncRNA，Pri-miRNA等）。
优势四：du家提供m6A一站式服务：m6A整体水平检测、m6A测序、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down等。
优势五：率先研发超微量MeRIP测序技术，RNA量低至500ng起。
优势六：国内*全的RNA修饰测序平台，提供m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、O8, G、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。

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