巴西队让一让,最新21.0版microRNA数据库上场了-技术前沿-资讯-生物在线

巴西队让一让,最新21.0版microRNA数据库上场了

作者:联川生物技术公司 2014-07-02T08:09 (访问量:2928)

随着巴西世界杯进入激烈的八强争夺赛,microRNA(miRNA)研究首选数据库Sanger miRBase最新21.0版终于在6月26日正式发布了。最新版数据库更新耗时较以往更长,这意味着miRNA数据增加的也比以往更多。新版数据库收录miRNAs总数量已突破35000条,相比上一版本(20.0版)增长近20%,新增4196条发夹前体序列和5441条成熟体miRNAs。新版数据库的可靠性进一步提升,清除了一些不明确的和错误注释的序列,又有72个条目被清理出数据库。

在21.0版数据库中,由于the Genome Reference Consortium (GRC)释放了人类基因组的最新版本GRCh38,miRBase参照最新基因组对人类miRNA数据进行了再次比对,去除了重复的条目,并新增了一部分发夹前体序列。该比对和修正过程进一步提升了人类miRNA数据的真实性。在新版数据库中,新报道了15个物种的miRNA序列,包括Capra hircus [山羊]1Salmo salar [大西洋鲑],Plutella xylostella [小菜蛾]2等,其中山羊和小菜蛾的miRNA数据均来自联川生物承担完成的小RNA测序项目。新增成熟体miRNAs在动物中最具代表性的有Pristionchus pacificus [秀丽线虫]新增451条;Equus caballus [野马]新增330条; Schistosoma mansoni [曼氏血吸虫]新增196条。植物中增长最为突出的是Gossypium raimondii [雷蒙德氏棉]新增292条,Aegilops tauschii [粗山羊草]新增171条,Triticum aestivum [小麦]新增77条。
 
1. Wu J, Zhu H, Song W, Li M, Liu C, Li N, Tang F, Mu H, Liao M, Li X. (2014) Identification of Conservative MicroRNAs in Saanen Dairy Goat Testis Through Deep Sequencing. Reproduction in Domestic Animals. 49(1):32-40
2. Liang P, Feng B, Zhou X, Gao X (2013) Identification and Developmental Profiling of microRNAs in Diamondback Moth, Plutella xylostella (L.). PLoS ONE 8(11), e78787.
 
联川生物作为业内领军的miRNA表达谱分析服务商,依托具有卓越性能的µParaflo®微流体定制化芯片技术,我们始终是全球第一家为用户提供最新版miRNA表达谱芯片分析服务的公司,第一时间为用户提供最新最全面的miRNA表达谱分析服务。对于miRNA未报道或报道较少的物种,我们可为用户提供基于高通量测序技术的miRNAome发现与表达谱分析服务。
即日起,联川生物接受用户预订使用最新21.0版miRNA表达谱芯片服务,优先体验我们高品质的miRNA表达谱分析服务。
联川生物技术公司 商家主页

地 址: 杭州经济技术开发区下沙6号大街260号中自科技园16幢4层

联系人: 吴先生

电 话: 0571-87662413

传 真: 0571-81951905

Email:market@lc-bio.com

相关咨询

快来围观,你离高分paper还差一个phasiRNA (2019-01-14T13:34 浏览数:4302)

如何选择合适的qRT-PCR内参基因? (2019-01-14T11:06 浏览数:18007)

为什么要做绝对定量测序-数据分析 (2018-09-21T17:59 浏览数:4097)

低通量单碱基m6A验证的新方法|m6A专题 (2018-09-18T16:04 浏览数:4113)

祝贺联川客户继Nature后又发一篇Nature Genetics (2018-09-18T16:03 浏览数:3884)

联川生物八月份客户文章汇总 (2018-09-18T16:02 浏览数:2813)

联川生物七月份客户文章汇总 (2018-09-18T16:01 浏览数:2775)

肝硬化与肝纤维化研究进展 (2018-09-18T16:01 浏览数:10574)

【用户案例】感染鲫鲤疱疹病毒2的银鲫中miRNA的差异表达 (2018-09-18T16:00 浏览数:2824)

病毒m6A专题 | HIV感染宿主促进病毒及T细胞m6A修饰 (2018-09-18T16:00 浏览数:3379)

ADVERTISEMENT