今天向大家隆重介绍联川的长期合作伙伴,一个非常高产的课题组,在环境微生物学和环境毒理学方面颇有建树,他们是——温州医科大学王慧利教授课题组
王慧利教授简介
温州医科大学生物学教授,主要从事环境微生物学和环境毒理学两方向的研究工作。主持国家自然科学基金3项,主持和参与省厅级项目多项。近年来,发表相关学术论文40余篇,其中SCI 30余篇,获得发明**4项。多次成功指导学生参加省级生命学科竞赛及申报省大学生新苗人才计划项目。
下面我们就一起来看看,近年来,王教授课题组发表的6项代表性成果。联川为王教授课题组提供高通量测序与数据分析支持。
一、钝顶螺旋藻内与耐盐性相关的microRNA-size sRNAs的鉴定
Identification of microRNA-size sRNAs Related to Salt Tolerance in Spirulina platensis
期刊:Plant Molecular Biology Reporter
IF:2.304
年份:2015
物种:钝顶螺旋藻
联川提供服务:miRNA测序、ACGT101-miR数据分析
研究内容:
通过对三种不同浓度(0.02M,0.3M,0.5 M)NaCl处理下的钝顶螺旋藻进行小RNA测序,验证msRNAs表达量,预测其靶基因,并通过GO和KEGG分析靶基因相关功能。利用蛋白质组学分析两个靶标蛋白质(甘油醛-3-磷酸脱氢酶和forkhead-associated (FHA) domain-containing protein),其功能表达可能受msRNAs调控。
研究结论:
钝顶螺旋藻中存在msRNAs,这些msRNAs可能在盐胁迫中发挥重要作用,但其功能意义需要进一步研究。
二、转录组测序分析β-双酮类抗生素对斑马鱼的慢性毒性影响
Chronic Toxicological Effects of β-Diketone Antibiotics on Zebrafish (Danio rerio) Using Transcriptome Profiling of Deep Sequencing
期刊:Environmental Toxicology
IF:2.868
年份:2015
物种:斑马鱼
联川提供服务:转录组测序
研究内容:
研究斑马鱼在长期低剂量β-双酮类抗生素药物(DKAs)胁迫下,所出现的差异表达基因,并通过qPCR及GO和KEGG通路分析,同时做了HE病理肝脏组织切片染色,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对斑马鱼的毒性影响。
研究结论:
为建立系统毒理学模型提供了基础,推进进一步阐述DKAs的生态风险和药源性疾病治疗。
三、β-双酮类抗生素胁迫下斑马鱼lncRNAs的筛选和功能鉴定
Screening and functional identification of lncRNAs under β-diketone
antibiotic exposure to zebrafish (Danio rerio) using high-throughput
sequencing
期刊:Aquatic Toxicology
IF:3.557
年份:2016
物种:斑马鱼
联川提供服务:lncRNA测序
研究内容:
通过研究斑马鱼在长期低剂量β-双酮类抗生素药物(氧氟沙星、环丙沙星、恩诺沙星、强力霉素、金霉素、土霉素;另称DKA)胁迫下所出现的lncRNAs的差异表达及其功能分析,利用原位杂交技术,结合HE病理切片观察,从分子角度初步论证药物痕量暴露下对斑马鱼各系统的影响。
研究结论:
DKAs胁迫导致的一些异常表达lncRNAs及其靶基因,在斑马鱼免疫系统中扮演了一个重要的调节功能。这对进一步研究环境压力胁迫下lncRNAs及其靶基因之间的交互作用,分析lncRNAs的功能具有重要意义。
四、转录组分析斑马鱼β-双酮类抗生素混合物下的免疫毒性
Immunotoxicity of β-Diketone Antibiotic Mixtures to Zebrafish (Danio rerio) by Transcriptome Analysis
期刊:PLoS ONE
IF:3.057
年份:2016
物种:斑马鱼
联川提供服务:转录组测序
研究内容:
通过研究长期暴露在六种β-双酮类抗生素(DKAs)混合药物,不同浓度(0, 6.25, 12.5, 25 and 50 mg/L)至性成熟的斑马鱼,分析其免疫相关基因的差异表达,以及主要免疫器官小肠和脾脏的生理病理学变化,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对斑马鱼免疫系统的影响。
研究结论:
DKAs长期胁迫下会对斑马鱼的免疫系统产生严重影响。
五、斑马鱼在β-双酮类抗生素胁迫下差异表达miRNAs分子的筛选及其功能研究
Screening on the differentially expressed miRNAs in zebrafish (Danio rerio) exposed to trace β-diketone antibiotics and their related functions
期刊:Aquatic Toxicology
IF:3.557
年份:2016
物种:斑马鱼
联川提供服务:miRNA测序
研究内容:
研究斑马鱼在长期低剂量β-双酮类抗生素药物(DKAs)胁迫下,所出现miRNAs的差异表达,通过qPCR及整胚、切片原位杂交技术,进行了时空表达验证,同时针对其可能影响到的靶器官进行了HE组织病理学染色,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对生物体的影响。
研究结论
DKAs的长期胁迫对斑马鱼具有广泛的毒理学效应
六、测序分析β-双酮类抗生素胁迫下对斑马鱼F1代的影响
Effects of b-diketone antibiotics on F1-zebrafish (Danio rerio) based on high throughput miRNA sequencing under exposure to parents
期刊:Chemosphere
IF:3.698
年份:2016
物种:斑马鱼
联川提供服务:miRNA测序、ACGT101-miR数据分析
研究内容:
研究斑马鱼在长期低剂量β-双酮类抗生素药物胁迫下,子一代所出现miRNAs的差异表达,并通过qPCR及整胚、切片原位杂交技术,进行了时空表达验证,同时针对其对子一代的影响情况在亲本精巢与卵巢中做了HE病理组织切片染色与原位杂交分析以及对应的生理病理学变化,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对斑马鱼性腺及子代的影响。
研究结论:
DKAS胁迫下将会对斑马鱼的生殖系统产生毒性。
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