病毒侵染会造成植株萎黄,生长迟缓,坏死或其他症状。叶绿体相关基因(ChRGs)的下调被认为与植株萎黄有关。然而尚缺乏实验证据支持这种观点。
浙江省农业科学院陈剑平院士课题组最近在国际知名期刊《新植物学家》(New Phytologist)上以“Identification and regulation of host genes related to Rice stripe virus symptom production”为题,报道了他们的最新研究成果,支持ChRGs与植株萎黄的相关性。燕飞研究员为本文的共同通讯作者。
课题组在水稻条纹病毒(RSV)侵染的本氏烟(Nicotiana benthamiana)上鉴定出一组差异表达的基因(DEGs)。研究人员采用烟草脆裂病毒(TRV)诱导基因沉默的方式逐一沉默基因,来考察75个表达下调基因对RSV症状产生的作用。
实验发现,沉默75个下调基因中的11个会造成植株萎黄,这11个中的9个基因是ChRGs。其中沉默1个下调基因——编码真核翻译起始因子4A(eIF4A)会造成叶片扭曲和萎缩,这种现象可见于RSV侵染的本氏烟上。进一步地,研究人员发现,RSV RNA4上的一个区域与eIF4A mRNA的部分片段互补,高通量测序证实上述病毒区域来源的小干扰RNA(vsiRNAs)在病毒侵染的本氏烟上表达。当以人工微RNA表达vsiRNAs,它们可以靶向调控NbeIF4A mRNA。
上述实验证据支持ChRGs与植株萎黄的相关性,并表明eIF4A参与RSV症状的发展。本研究也是第一份报告证明,直接来自植物病毒的siRNA可以靶向调控宿主基因。
本项目中高通量测序鉴定vsiRNAs由联川协助完成
参考文献
Shi BB, et al. (2015) Identification and regulation of host genes related to Rice stripe virus symptom production. New Phytologist. doi: 10.1111/nph.13699