microRNA表达谱研究促进了对分子电路的认识
microRNA (miRNA)的调控机理十分复杂,因为miRNAs通常被转录成初级转录本,变成多个独立的成熟miRNAs,而每个miRNA可能作用于多个不同的靶mRNA。因此,miRNA就是一个控制细胞功能的网络。此外,许多miRNA家族的结构具有高度保守性,这表明它们在协调编程功能中扮演着重要的角色。完整的microRNA组(microRNA-omes)表达谱使研究人员能够从全局观察这一网络,更好地理解各因素相互作用的关系。
目前已经证实,miRNA在许多细胞活动中发挥着重要的调控作用,如细胞发育和分化。特别是在人类干细胞(human embryonic stem cells ,hESC)中,microRNA起着十分重要的作用,hESC中的 miRNA可调控细胞的自我更新、多能性和细胞分化。而且,更好地理解涉及成人细胞重编程为可诱导多功能干细胞 (induced pluripotent stem cells ,iPSCs)的分子电路机理,有助于获得可回避使用人类胚胎进行研究的实验方法,并有可建立疾病特异性的干细胞的模型体系。
在最近的一项研究中,斯坦福大学的研究人员对人类iPSC、hESC和胎儿成纤维细胞(fibroblast)的microRNA组进行了比较研究,阐明了有关细胞多能性与细胞重编程的调控网络[1]。研究人员使用LC Sciences的微阵列服务,获取了当时所有已知miRNA的表达谱。微阵列数据揭示了一组特征性的miRNA同时在iPSC和hESC中表达上调(相对于fibroblast),同时有一簇miRNA在iPSC和hESC中具有显著差异表达。研究人员也注意到多能细胞与分化的成纤维细胞的miRNA表达谱存在较大的的差异,并利用Real-time PCR方法对miRNA的表达谱进行了有针对性的验证。
通过研究miRNA表达谱和各种因素, 比如miRNA簇群基因图谱和它们的基因组位置及靶标基因的功能,能更好地理解miRNA作用的复杂机理。
LC Sciences提供全方位的miRNA表达谱分析服务,帮助研究人员快捷地进行多样品间的表达谱分析。公司拥有灵活的µParaflo® 技术使我们的微阵列能够与Sanger miRBase数据库保持同步更新(最新版本为13.0),揭示出最完整的miRNA样品表达谱。LC Sciences提供的标准微阵列涵盖miRBase数据库报道的所有物种。服务还包括:探寻新miRNA的测序服务与Real-time PCR验证服务。
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1.Wilson KD, Venkatasubrahmanyam S, Jia F, Sun N, Butte AJ, Wu JC. (2009) MicroRNA Profiling of Human-Induced Pluripotent Stem Cells. Stem Cells Dev 18, 749-758.