茄科包括许多重要的蔬菜作物,它们经常遭受盐胁迫。 microRNA(miRNA)已被发现参与调控植物的基因表达来应答盐胁迫。然而,几乎没有关于茄科植物miRNA参与此类应答的报道。由江苏省农业科学院蔬菜研究所庄勇副研究员领衔的课题组采用小RNA测序技术对此展开了深入分析*,研究成果发表在近期的International Journal of Molecular Sciences上。
为鉴定盐胁迫响应miRNAs,研究人员首先从NaCl处理和NaCl不处理的盐耐受品种—Solanum linnaeanum根中构建2个小RNA文库,并进行了高通量测序分析(由联川生物承担测序分析工作)。测序鉴定出来自37个家族的98个保守miRNAs,其中一些miRNA和其表达谱已被定量PCR验证。在盐胁迫下,11个miRNAs表达出现下调,3个miRNAs表达上调。接着研究人员对这些盐胁迫应答miRNAs的靶基因进行了预测,发现它们参与了多种植物中的细胞进程。此项研究为miRNA在S. linnaeanum中的功能研究提供了有价值的信息,并有助于开发茄科作物的遗传改良策略。
*Zhuang Y, Zhou XH, Liu J. Conserved miRNAs and their response to salt stress in wild eggplant Solanum linnaeanum roots.(2014) Int J Mol Sci. 839-849 [article]
获取更多用户研究案例,请访问www.lc-bio.com或拨打免费咨询热线800-857-1452。