动物生长曲线可以为动物育种提供必要的信息,以优化饲养和管理策略。然而,在生长曲线拐点和渐近阶段之间的表型分化的潜在遗传机制尚没有被充分的表征。
本研究中,四川农业大学动物科技学朱砺教授课题组携手联川生物科研团队,以处在生长拐点(UIP)和两个渐近阶段(拐点前:BIP,拐点后:AIP)的凉山猪为模型,采用数字基因表达谱(DGE)测序对背最长肌的基因表达谱进行了系统考察。研究人员发现凉山猪达到最大生长率(UIP)时为163.6日龄,体重为134.6 kg。DGE文库共产生117M reads,序列长度为5.89 Gb。研究人员分别从BIP,UIP,和AIP中鉴定到21,331,20,996,和20,139个转录本。其中,在BIP与UIP之间鉴定到757个差异表达基因,在AIP和UIP之间,鉴定到271个差异表达基因。对差异表达基因的富集分析证明免疫系统在AIP阶段被增强。而能量代谢率,全局转录活性,和骨发育强度在UIP是最高的。在AIP时,凉山猪的猪肉具有最高的肌内脂肪含量和最有利的脂肪酸组成。380个(27.70%)特异表达的基因高度富集于生长和肉质性状相关的QTL区。
本研究对生长过程的拐点和渐进阶段的不同遗传机制进行了全面分析。此项研究结果将成为理解地方猪品种生长和发育的重要资源。
本项目的DGE测序由联川生物承担完成
参考文献
Shen L, Luo J, Du J, Liu C, Wu X, Pu Q, et al. (2015) Transcriptome Analysis of Liangshan Pig Muscle Development at the Growth Curve Inflection Point and Asymptotic Stages Using Digital Gene Expression Profiling. PLoS ONE 10(8): e0135978. doi:10.1371/journal.pone.0135978