1.microRNA芯片数据在疾病如阿尔茨海默氏症的早期诊断中具有重要价值
由于microRNA(miRNA)的稳定性和测序技术的进步,使得miRNA表达谱分析成为了研究特定生物过程的可靠方法。然而,这种方法会受miRNA广泛特异性的限制,即它可能靶向多个mRNA。在最近的研究中,来自东南大学生物科学与医学工程学院的研究人员开发了一种对miRNA芯片或深度测序数据进行全面注释的方法,可进行细胞生物效应研究(miRNA芯片数据来自联川生物)。使用这种方法,研究人员在四个独立样本中预测出了具有高度相关性的涉及阿尔茨海默氏病的特异信号通路和生物学过程。不仅如此,利用该方法也成功地对碲化镉(CdTe)纳米材料的细胞毒性进行了评估。结果显示,细胞凋亡通路被选定为与CdTe纳米粒子胁迫作用最为相关的通路。上述发现有助于验证用于早期疾病诊断的miRNA芯片和深度测序结果,也有助于评估新材料和药品的生物安全性。
文章出处:Bo Sun, Fei Yang, Fei-Hu Hu, Ning-Ping Huang, and Zhong-Dang Xiao. (2013) Comprehensive annotation of microRNA expression profiles. BMC Genet 14: 120.
2.miR-200b在前列腺癌治疗中的潜在效用
miRNA在转录后水平调节基因表达并微调关键的生物过程,包括癌症发展。最近,来自美国西北大学Feinberg医学院的研究人员证实了miR-200b参与了前列腺癌的转移扩散。研究人员利用联川生物miRNA芯片分析发现miR-200b是雄激素受体的下游靶标,它的表达与前列腺癌细胞的致瘤性和转移能力下降相关。过表达PC-3细胞中的miR-200b会显著抑制细胞增殖和皮下肿瘤的形成。此外,在原位模型中,miR-200b会阻断PC-3细胞的自发转移和血管生成。这种降低转移的潜力可能是由于逆转了上皮细胞向间充质细胞转化而引起的,泛上皮标记E-cadherin和前列腺上皮细胞的特异性标记——细胞角蛋白8和18的增加是有力的证据。与此相反,研究人员发现,间充质标记——纤连蛋白和波形蛋白受到miR-200b调控而显著下调。上述研究结果表明,miR-200b在前列腺癌发展中的重要作用并预示其在前列腺癌治疗中的潜在作用。
文章出处:Williams LV, Veliceasa D, Vinokour E, Volpert OV. (2013) miR-200b Inhibits Prostate Cancer EMT, Growth and Metastasis. PLoS One 8(12):e83991.
3.BARD1具有肿瘤诊断的潜力
在过去的几年中,BARD1(BRCA1-associated RING domain 1)已被认为既是BRCA1(乳腺癌易感基因1,早发性)的相互作用因子又是乳腺癌和卵巢癌中突变的抑癌基因。尽管它是BRCA1稳定的异源二聚体,但越来越多的证据表明,BARD1也具有不依赖BRCA1的致癌作用。在最近的一项研究中,来自那不勒斯第二大学的研究人员利用RT-PCR和联川生物miRNA芯片对人类急性髓系白血病中BARD1的表达和功能,以及其受到表观遗传和miRNA调控的机制进行了研究。结果表明,HDACi(组蛋白去乙酰化酶抑制剂)Vorinostat(抗癌药)是通过上调miR-19a和miR-19b表达水平来降低BARD1 mRNA的表达水平。此外,研究人员还鉴定出一个特异的BARD1亚型,可能作为肿瘤诊断和预后的标志物。
文章出处:Lepore I, Dell’aversana C, Pilyugin M, Conte M, Nebbioso A, De Bellis F, Tambaro FP, Izzo T, Garcia-Manero G, Ferrara F, Irminger-Finger I, Altucci L. (2013) HDAC Inhibitors Repress BARD1 Isoform Expression in Acute Myeloid Leukemia Cells via Activation of miR-19a and/or b. PLoS One 8(12), e83018.
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