大量的证据表明,microRNAs(miRNAs)丰富地存在于肝脏中,并对肝脏的发育,再生及疾病的发生发挥着重要作用。为了更好地促进肝脏疾病与海洋生物的研究,近日,浙江理工大学的吕正兵教授,领衔其团队,对条纹斑竹鲨肝脏的miRNA进行了深入研究,研究成果发表在7月刊的BioMed Research International上。
虽然条纹斑竹鲨的基因组测序尚未完成,但最近提出的叶吻银鲛(callorhinchus milii)基因组是一个软骨鱼类基因组理想模型。因此,研究人员使用叶吻银鲛基因组预测pre-miRNA的发夹结构。通过小RNA测序,共有91个已知的miRNA和166个假定候选的miRNAs首次在条纹斑竹鲨中得到鉴定(小RNA测序服务由联川生物完成)。通过目标预测和GO分析, 在91个已知的miRNA中,筛选出46个miRNAs,特别是细胞增殖和生长相关的miRNAs。
研究人员进一步通过RT-PCR分析条纹斑竹鲨的miRNAs簇以及miRNAs的表达。在正常和再生肝组织中筛选出差异表达的基因,通过鉴定得到十个序列。
本研究是关于软骨鱼miRNA的首次全面报道, 为条纹斑竹鲨现有的数据库添加了大量新的miRNA序列信息,并为进一步研究miRNAs在条纹斑竹鲨肝脏发育中的功能奠定了基础,不仅为鱼类也为其它物种的肝脏miRNA研究做出了贡献。
*Conger Lu, et al. (2013) Study of MicroRNAs Related to the Liver Regeneration of the Whitespotted Bamboo Shark, Chiloscyllium plagiosum. BioMed Research International . [article]
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