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单细胞功能蛋白组学在肿瘤研究及治疗中的应用

作者:IsoPlexis 2022-02-24T03:18 (访问量:10337)

*部分文章内容转载自转化医学网

肿瘤的发生、生长到转移的机制,是一连串复杂的机制。从基因组学、肿瘤微环境到宏观生活环境,每个环节或是多重因素结合,都有可能触发肿瘤的增生。单细胞测序技术和生物信息学的进步,揭示了在肿瘤研究中单个细胞水平遗传异质性的重要性;然而,基因组学仅回答了基因层面的问题,未能解读到蛋白层面及其功能性,因此,单细胞蛋白组学研究工具的开发已成为完整解密的新希望。

癌症耐药性会导致疗效不佳或治疗后复发,是癌症治疗中的一个重大挑战。加州理工学院David Baltimore课题组在Nat Communications发表的文献 “Multi-omic single-cell snapshots reveal multiple independent trajectories to drug tolerance in a melanoma cell line”中提及,研究人员利用病人来源的BRAFV600E突变黑素瘤细胞系(M397),建立了靶向抑制剂诱导的快速药物耐受模型。在BRAF抑制剂(BRAFi)作用下,这些高度可塑性细胞从初始的药物敏感状态转变成后期耐药状态(图1),研究人员通过单细胞条形码芯片(SCBC)进行功能蛋白质组和代谢物分析,研究这一过程中相关的表型标志物和致癌信号标志物、肿瘤信号转导、细胞增殖和代谢活动等,洞察肿瘤耐药产生的关键机制。

1. 黑素瘤M397细胞在BRAFi处理不同天数后采用IsoPlexis单细胞蛋白组和代谢组芯片进行分析

PD-1免疫疗法是当前备受瞩目的新一类抗癌免疫疗法,如在文献Bempegaldesleukin Plus Nivolumab in First-Line Metastatic Melanoma. J Clin Oncol. 2021 Jul中,研究人员采用了IsoPlexis单细胞蛋白质组学分析技术,对患者治疗前后外周血中T细胞和NK细胞的单细胞多功能强度指数(PSI)进行了分析(图2)。研究发现,CD8+细胞的PSI增加与客观缓解改善呈正相关,通过这一生物标志物可以让研究人员比使用传统技术更早地评估患者对Nivo/Bempeg治疗的反应。


2. 治疗后,治疗缓解组(CR+PR)患者的CD8+ T细胞的PSI升高约2.2倍

帮助科学家们寻找英雄细胞与坏蛋细胞是我们IsoPlexis的使命。

20211029-31第三届上海国际癌症大会在上海松江召开并圆满落幕。国内外肿瘤研究领域的顶尖学者专家共聚申城,探讨癌症领域从基础到临床、科研到转化的最新进展、最新技术和最新发展趋势,共同推动癌症诊治技术、方法创新,促进基础研究向临床和产业转化。

IsoPlexis演讲嘉宾李倩博士在单细胞及多组学论坛上发表名为《单细胞功能蛋白组学在肿瘤研究及治疗中的应用》的演讲,与大家分享了IsoPlexis的单细胞功能蛋白质组学在推动肿瘤免疫治疗研究领域的应用趋势和技术优势。


IsoPlexis13号展台展出的IsoPlexis的单细胞功能蛋白质组学分析平台,涵盖多个实验操作和检测体系,通过特有的芯片检测技术可以同时捕获成千上万的单个活细胞。IsoPlexis展台吸引了诸多专家学者前往交流,IsoPlexis工作人员认真解答每个咨询问题,希望在推动肿瘤研究及精准医疗的发展中贡献自己的一份力量。


单细胞蛋白质组学肿瘤研究及治疗中优势

蛋白质是生命功能的主要执行者,常规的蛋白质组学是研究种群获得平均化结果,忽略个体化差异。而开展单细胞蛋白质组学研究能根据差异蛋白质信息进一步了解细胞异质性,从而准确了解疾病的发生、发展。无论是在肿瘤早期诊断、癌症机制研究还是肿瘤免疫治疗等领域,单细胞蛋白质组学都是一种不可或缺的技术手段。

作为行业领军企业,IsoPlexis凭借强大的科技实力推动单细胞蛋白质组学技术的持续性创新,专注于提供精准高效的单细胞多重功能蛋白质检测解决方案,助力单细胞蛋白质组学在癌症诊断和治疗等方向的研究突破。

第三届上海国际癌症大会已落下帷幕,大会围绕传承,创新,卓越,引领的主题,分析了我国癌症研究治疗领域的最新进展和成果,也为今后癌症医学领域的学术发展提供方向和指引。期待未来有更多的学习和交流机会,携手并进,共促发展。

IsoPlexis未来会继续保持锐意进取、永不懈怠的精神状态,持续探索癌症精准医疗领域的发展之路。最后, 祝贺大会圆满成功! 期望您持续关注我们的最新动态,共创辉煌,共赢未来!


以上数据来源

Diab A, Tykodi SS, Daniels GA, Maio M, Curti BD, Lewis KD, Jang S, Kalinka E, Puzanov I, Spira AI, Cho DC, Guan S, Puente E, Nguyen T, Hoch U, Currie SL, Lin W, Tagliaferri MA, Zalevsky J, Sznol M, Hurwitz ME. Bempegaldesleukin Plus Nivolumab in First-Line Metastatic Melanoma. J Clin Oncol. 2021 Jul 13:JCO2100675. doi: 10.1200/JCO.21.00675. Epub ahead of print. PMID: 34255535.

Schmidts A , Ormhj M , Choi B D , et al. Rational design of a trimeric APRIL-based CAR-binding domain enables efficient targeting of multiple myeloma - ScienceDirect[J]. Blood Advances, 2019.

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