2010年9月10日,Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至16.0版。在新版本中,发夹前体序列升至15172条,新增1068条;成熟miR和miR*产物共17341条,新增1788条;新版本报道序列共涵盖142个物种。
新增microRNA序列动物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增108条,Mus musculus [小鼠]新增82条,Rattus norvegicus [大鼠]新增82条,Sus scrofa [猪]新增36条。植物物种中增长最为显著的是Glycine max [大豆] 和Citrus sinensis [橙],分别增加118条和50条。
此外,新版本中首次收录的物种共有9个,包括:
1).2个动物物种:Nasonia giraulti [胡蜂] (32),Nasonia longicornis [金小蜂] (28)
2).6个植物物种:Picea abies [挪威云杉] (40),Arabidopsis lyrata [琴叶拟南芥] (201),Aegilops taushii [粗山羊草] (2),Festuca arundinacea [高羊茅] (15),Hordeum vulgare [大麦] (13),Triticum turgidum [圆锥小麦] (1)
3).Ectocarpus siliculosus [长囊水云] (26)
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关于miRBase
miRBase序列数据库是一个提供包括miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息,详情请访问http://www.mirbase.org/。
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