重组链激酶能促进体内纤维蛋白溶解系统的活力，使纤维蛋白溶酶原转变为活性的纤维蛋白溶酶，引起血栓内部崩解和血栓表面溶解。
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甲状旁腺素（PTH）是甲状旁腺主细胞合成和分泌的多肽激素，为脊椎动物体内调节钙、磷代谢平衡的主要激素之一。其主要的靶器官为骨骼、小肠和肾脏它通过和靶细胞膜上特异性受体结合引起靶细胞功能改变而发挥其生物学作用骨。
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青霉素G酰化酶作用于青霉素G、头孢菌素G和相关抗生素产生β-内酰胺抗生素中间体6-氨基青霉烷酸（6-amino penicillanic acid，6-APA）或7-氨基-3-去乙酰氧基头孢烷酸（7-amino des-acetoxy ce
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内皮抑素是一种天然存在的20 kDa的多肽来自第十八型胶原蛋白的C-末端部分。它作为一种抗血管生成的细胞因子的表达在各个器官的最高水平，肝，肺，肾功能。血管内皮抑制素抑制血管生成的通过阻断促血管生成的VEGF和FGF-基本活动。
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干细胞因子(SCF) 是一种广泛表达的Ⅰ型跨膜糖蛋白，可促进骨髓细胞、红祖细胞、巨核细胞等多种细胞的生存、分化和动员。在骨髓培养中，SCF刺激髓样祖细胞，红系造血祖细胞和淋巴样祖细胞等的增殖，并和集落刺激因子具有协同作用。成熟的
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肿瘤坏死因子-α(Tumor Necrosis Factor-alpha，TNF-α)是一种主要由单核-吞噬细胞产生的单核因子，不仅具有选择性地杀伤某些肿瘤细胞，而且有多种免疫调节作用。
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干扰素是一类具有抗病毒、抗肿瘤、免疫调节作用的重要细胞因子，干扰素可分为三类：I型、II型和III型。人干扰素β属于I型干扰素。干扰素β主要由成纤维细胞和某些上皮细胞在细菌、病毒、核苷酸等刺激物诱导下产生。
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小分子泛素相关修饰蛋白（small ubiquitin-related modifier, SUMO）可用在工程菌中融合表达异源蛋白，利用SUMO作标签表达的重组蛋白在进一步的分离纯化过程中，必须使用SUMO蛋白酶进行切割。
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肠激酶（Enterokinase）是一种高度专一识别—Asp-Asp-Asp-Asp-Lys—序列的蛋白酶，在Lys 的C端水解多肽，它可以将胰蛋白酶原转变为胰酶，也可以将带有这个识别序列的融合蛋白切开。
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