化学蛋白质组学是将化学工具与蛋白质组学技术相结合的一门交叉学科，旨在全面解析蛋白质的结构、功能及其与小分子化合物的相互作用。化学蛋白质组学的核心原理是利用化学探针或反应性分子特异性地标记蛋白质或其修饰位点，通过质谱等高通量手段检测这些标记物并解析相关蛋白质网络，常用的技术包括活性基质捕获（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）、靶标鉴定（Target Identification）、共价结合组学（Covalent Proteomics）等。例如，ABPP通过设计具有特定反应活性的化学探针，选择性捕捉某类酶的活性位点，从而解析酶功能；而靶标鉴定技术则利用化合物与蛋白质之间的直接相互作用，识别化合物的生物学作用靶点。这些方法通常以高分辨率质谱为核心，结合化学标记、蛋白质分离和生物信息学分析，为研究者提供高灵敏度、高通量的解析能力。与传统蛋白质组学方法相比，化学蛋白质组学注重从化学反应的角度揭示蛋白质与其环境的相互关系，特别适用于探索蛋白质修饰、动态复合体及化合物筛选等方面。近年来，随着质谱技术、化学探针设计和生物信息学的快速发展，这项技术在疾病机制研究、药物开发及精准医学中显示了巨大潜力。

一、实验流程与关键步骤

化学蛋白质组学实验流程一般分为化学探针设计、样品处理、标记反应、蛋白质分离、质谱分析和数据解析等步骤。

1、研究者根据实验需求设计化学探针，这些探针需要具备靶向性和化学稳定性。

2、通过将探针与细胞或组织样品反应，选择性标记目标蛋白质或功能位点。

3、通过蛋白质分离技术（如亲和层析、凝胶电泳等）纯化标记蛋白，利用质谱分析技术鉴定其种类及修饰信息。

4、借助生物信息学工具对数据进行全面解析，揭示蛋白质的功能网络及其与化学探针的结合特性。

二、应用与意义

化学蛋白质组学在多个领域展现了广泛的应用价值。在药物开发中，这一技术被用来识别候选化合物的靶点及其作用机制，优化药物的选择性和活性。在基础研究中，这一技术通过揭示蛋白质的动态修饰状态和功能关系，为研究疾病分子机制提供了关键线索。此外，它还在抗体药物开发、代谢网络解析以及生物标志物发现中有着重要应用；例如，通过设计特异性的化学探针，可以直接标记某类致病相关酶的活性位点，帮助科学家理解疾病进程并寻找精准治疗靶点。

三、注意事项

尽管化学蛋白质组学技术强大，但其应用仍面临一些挑战。化学探针的设计需要在靶向性和反应活性之间取得平衡，同时避免非特异性标记；实验条件包括反应时间、温度和溶液条件等，都可能影响标记效率。此外，由于质谱数据复杂且量大，数据分析需要强大的生物信息学支持。为了确保研究的科学性和结果的可靠性，研究者需要多角度验证实验结果，例如结合生化实验或其他组学技术进行交叉验证。

化学蛋白质组学通过将化学工具引入蛋白质组学研究，为解析蛋白质功能和分子网络提供了全新的视角。百泰派克生物科技为客户提供专业的化学蛋白质组学服务，包括化学探针设计、质谱分析及数据解析。我们拥有先进的技术平台和丰富的实践经验，可根据客户需求定制实验方案，为您的科研和产业项目提供高质量的技术支持。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

>>点击了解更多优质服务项目