表达谱芯片服务

简介

表达谱芯片是采用cDNA或寡核苷酸片段作探针，固化在芯片上，将待测样品（处理组）与对照样品的mRNA以两种不同的荧光分子进行标记，然后同时与芯片进行杂交，通过分析两种样品与探针杂交的荧光强度的比值，来检测基因表达水平的变化。被广泛用于疾病研究、临床诊断、药物筛选等领域。

应用领域

疾病研究： 研究疾病的基因表达时空特征，揭示疾病的分子基础； 研究疾病的基因表达差异，寻找疾病分型的分子指标；研究疾病治疗前后的基因表达差异，从基因组学上评估其时效性。

临床诊断： 可用于某些疾病的临床诊断。

药物筛选： 药物药理机制分析，药物的毒性毒理研究。

实验平台

客户根据需要，可以选择不同厂家的全基因组表达谱芯片，包括Agilent、llumina、 Affymetrix和Roche NimbleGen 四大平台，还将为您提供全基因组表达谱芯片分析以及后续的生物信息学检测分析服务。

（1）Agilent全基因组表达谱芯片

安捷伦伦高性能的表达谱芯片为客户的基因表达研究提供了灵活以及高性价比的研究平台，产品芯片覆盖了30多种不同物种，配备以高品质的60-mer寡核苷酸针，设计出以4× 44K规格为主的表达谱芯片。此外客户可以根据自己的需要在安捷伦的eArray在线服务平台设计任何需要的芯片，不受目录芯片限制。

技术特点

独特的SurePrint原位合成技术：SurePrint技术依靠强大的探针设计运算法则和准确的确认方法，无需“光掩膜”，并利用工业规模的喷墨打印技术和独特的质控程序来合成芯片。

双色芯片检测：可以根据客户的需要，将相互比较的两个样本分别用不同的荧光标记，杂交在同一张芯片上。相较于到传统的单色芯片检测，此方法可以发现更微小的表达差异，并有效地控制实验的批次差异。

用量少：只需200ng 总RNA 即可用来进行标记实验（不包括质检所消耗的量），大大降低了RNA抽提的难度，能让客户利用剩下的总RNA进行验证。

灵活方便的定制服务：安捷伦公司除了提供成品芯片外，还开放了一个免费的eArray芯片设计平台，让客户可以根据自己的需求设计专有的芯片，同时亦可让客户分享其他客户的定制芯片，满足客户不同的研究需要。

检测原理

用两种不同的荧光分别标记实验组和对照组扩增后的cRNA，调整好两组的杂交用量，然后与表达谱芯片杂交，通过扫描芯片上两种荧光（红、绿）的相对强度比率，两组RNA有差异的部分会出现颜色偏移，从而计算出相应基因表达量是上调还是下调。如果选择做单色荧光标记的表达谱芯片检测，只需用一种荧光标记一个样本进行杂交即可。

样品要求：

1) 样品纯度：OD 260/280值应在1.8～2.2 之间；260/230在1.8-2.3之间；电泳显示无RNA降解，无基因组DNA污染；RIN≥8.0
2) 样品浓度：最低浓度不低于20ng/μl；
3) 样品总量：每个样品总量不少于2μg；
4) 样品溶剂：RNA需溶解在无核酸