Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix-生物分子-试剂-生物在线
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Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix

Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix

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产品名称: Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix

英文名称: Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix

产品编号: HZ2303

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产品产地: 中国/上海

品牌商标: 沪震生物

更新时间: 2023-08-17T10:24:20

使用范围: null

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 Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix

描述:本制品是以 RNA 为模板,采用探针法进行 Real-Time PCR 的 专 用 试 剂 , 适 合 于 FAM/HEX/TET/JOE/ROX 等双标记探针(本品也适用于 Molecular Beacon 探针)。其中 5×Fast One-Step RNA TaqMan qPCR Mix 是将热启动 Fast Taq DNA 聚合酶、 MLV 反转录酶、Rnase Inhibitor、反应 Buffer、dNTP 等试 剂预混的一种 5×浓度的单组分预混试剂。进行实验时, PCR 反应液的配制十分方便简单,只需加入引物、探针、 模板、水即可。该制品不含有 ROX 校正染料,适用于各 种荧光标记探针,并且适用于各种定量 PCR 机型。 制品中的 Fast Taq DNA 聚合酶采用专有的热启动技 术确保 55℃以下没有任何活性,因此可在室温建立反应 体系。Fast Taq DNA 聚合酶具有卓越的扩增速度,因此满 足快速 PCR 程序,通常在 30min 以内可以完成扩增反应。 同时该聚合酶具有耐受杂质的能力,同样适用于粗制核酸 样本的扩增反应。 包装 规 格 250T 1000T 5×Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix 1 ml 1 ml×4 储存: (1) 长期保存,请避光置于-20℃或-70℃可保存3年。 (2) 经常使用,融化后可置于 4℃,可保存 1 年。 TaqMan 荧光定量 PCR 试剂盒 操作方法 1. 进行 RNA 的 One-Step qPCR 检测 进行 RNA 的 qPCR 检测时,检测模板为 RNA,在反转录 酶的作用下,由下游引物进行反转录反应,反转录反应完 毕后获得 cDNA,再启动 PCR 的扩增,并对 cDNA 进行 扩增,整个过程在一种试剂中一步完成(One-Step qPCR)。 按照如下组分配制 20 μl PCR 反应体系: 终浓度 5×Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix 4 μl 1× PCR Forward Primer(10 μM) 0.4 μl 0.2 μM PCR Reverse Primer(10 μM) 0.4 μl 0.2 μM Probe (10 μM) 0.2 μl 0.1 μM RNA 模板 0.5~2 μl ddH2O Up to 20 μl 注意:(1)通常使用 0.4 μl 的扩增引物可获得理想的扩增结果,必 要时可在 0.2~0.8 μl 之间进行调整。 (2)探针的浓度在 50~250 nM 之间调整;在双探针检测时通常探 针用量减半,扩增引物浓度保持不变。 (3)qPCR 灵敏度极高, 建立反应体系时加入模板量的准确程度对 最终定量结果会有很大的影响。建议将模板稀释后加入反应体系 中,这样可以有效提高实验的重复性。 2. RNA 的 One-Step qPCR 反应程序如下: Stage 1: 55℃ 10min(反转录获得 cDNA) Stage 2: 95℃ 30s Stage 3: 95℃ 5s 60℃ 20s(收集荧光信号) 40 cycles 注意:(1)预变性 30s 适合绝大多数扩增反应,如模板结构复杂, 可将预变性时间延长至 3 min。 (2)对于 200 bp 以内的片段,延伸时间最短可设为 10 sec;超过 200 bp 时,推荐延伸时间为 20-30 sec。 3. 反应结束后确认 Real-Time PCR 的扩增曲线。盒 探针设计原则 1. 探针位置尽可能地靠近上游引物。 2. 探针长度应在 15-45bp(最好是 20-30bp),以保证结合特 异性。 3. 探针 Tm 值在 65-70℃,通常比引物 TM 值高 5-10℃(至 少要 5℃),GC 含量在 40%-70%。4. 探针的 5’端应避免使用 G,因为 5G 会有淬灭作用。 5. 整条探针中,C 的含量要明显高于 G 的含量;避免 出现重复的碱基。 6. 为确保引物探针的特异性,最好将设计好的序列 blast 中核实一次,如果发现有非特异性互补区,建议重新设 计引物探针。 7. 尽量避免出现重复的碱基,尤其是 G 碱基,应避免出现 4 个或 4 个以上的 G 重复出现。 常见问题与解决方案 1.扩增曲线异常 (1) 扩增曲线不平滑:模板浓度太低或模板纯度低,换用高 质量模板。 (2) 扩增曲线断裂或下滑:模板浓度较高引起,基线的终点 值大于 CT 值。减小基线终点(CT 值-4),重新分析数据。 (3) 个别扩增曲线突然下降:反应管内留有气泡,配好反 应体系上机前要进行离心,避免管里气泡的出现。 2. 反应结束无扩增曲线 (1)确认程序设置是否正确:是否设置了收集信号步骤,两步 法扩增程序一般设置在退火延伸阶段,三步法设置在 72℃ 延伸阶段。 (2) 模板降解或浓度偏低:如模板降解需重新制备新的模板, 浓度偏低可通过减少稀释度重复实验,一般未知浓度的样品 先从最高浓度做起。 (3) 确认引物是否降解:长时间未用的引物应先通过 PAGE 电泳检测完整性,以排除其降解的可能。 3. CT 值偏大 (1) 扩增效率低:优化反应条件包括引物序列和引物浓度, 或尝试三步法扩增程序。 (2) 模板降解或浓度偏低:如模板降解需重新制备新的模板, 浓度偏低可通过减少稀释度重复实验,一般未知浓度的样品 先从最高浓度做起。 (3) PCR 产物太长:推荐 PCR 产物长度为 100- 200 bp。 (4) 体系中存在 PCR 抑制剂:一般为模板带入,将模板加大 倍数稀释后再进行扩增,或重新制备模板。 4. 阴性对照出现明显扩增 (1) 反应体系污染:用气溶胶去除剂处 理实验台面和环境,更换新的 Mix、水、引物再进行实验。 (2) 引物二聚体的出现:配合融解曲线进行分析。 5. 绝对定量时标准曲线线性关系不佳 (1) 模板浓度太高:提高模板稀释倍数,采用专用稀释液。 (2) 某个标准品降解:重新制备标准品再进行实验。 (3) 加样误差:提高模板稀释倍数后再进行实验。 6. 实验重复性差 (1) 加样体积导致:提高模板稀释倍数,用准确的移液器。 (2)定期校准 qPCR 仪器和移液器。 (3) 模板浓度太低:模板浓度越低,重复性越差,减少模板 稀释度或提高加样体积。

5×Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix是采用探针法进行Real-Time PCR的专用试剂,适合于FAM/HEX/TET/JOE/ROX等双标记探针(本品也适用于Molecular Beacon探针)。其中5×Fast One-Step RNA TaqMan qPCR Mix是将热启动Fast Taq DNA聚合酶、MLV反转录酶、Rnase Inhibitor、反应Buffer、dNTP等试剂预混的一种5×浓度的单组分预混试剂。进行实验时,PCR反应液的配制十分方便简单,只需加入引物、探针、模板、水即可。该制品不含有ROX校正染料,适用于各种荧光标记探针,并且适用于各种定量PCR机型。
5×Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix中的Fast Taq DNA聚合酶采用专有的热启动技术确保55℃以下没有任何活性,因此可在室温建立反应体系。Fast Taq DNA聚合酶具有卓越的扩增速度,因此满足快速PCR程序,通常在30min以内可以完成扩增反应。同时该聚合酶具有耐受杂质的能力,同样适用于粗制核酸样本的扩增反应。

组分

名称 250T 1000T
5×Fast One-Step RNA Probe qPCR Mix 1ml 1ml*4

主要特征

  • 热启动酶采用专有的修饰方式,30s热启动
  • 一步法RNA TaqMan qPCR单组份预混试剂
  • 卓越的扩增性能,耐受样本中的杂质能力强
  • 高灵敏度,可检测低丰度基因
  • 适用于所有实时定量PCR仪器

应用

RNA的相对定量检测。

注意事项

储存

1. 长期保存,请避光置于-20℃或-70℃可保存3年。
2. 经常使用,融化后可置于4℃,可保存1年。

反应实例

以人MCF7细胞提取的总RNA(1.28 pg-20 ng)为模板,应用5xFast One-Step RNA Probe qPCR Mix直接进行qPCR,扩增结果如图A: 扩增曲线;B:标准曲线。1-8RNA模板分别为:20 ng、4 ng、0.8 ng、0.16 ng、0.032 ng、6.4 pg、1.28pg和H2O。

 

 

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