宏基因组测序（第二代高通量测序 微生物基因功能分析）
宏基因组测序对特定生境样品中微生物群体基因组进行序列测定，进而分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体多样性与丰度，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。
数字基因表达图谱分析
数字基因表达谱测序是用来研究某一生物对象在特定生物过程中基因表达差异的技术，该技术可广泛应用于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。
真菌基因组测序（比较基因组 基因功能 基因注释）
真菌属于较低等的真核生物，基因组较小；真菌基因组的测序将为真菌特性的分析提供有用的依据；随着新一代高通量技术的成熟，真菌基因组测序成本已大大降低。
全基因组测序
全基因组测序WGS（Whole Genome Sequencing）是使用高通量测序平台对一种生物样本的基因组中的全部基因和非基因序列进行测序，测定其DNA 的碱基序列。
小RNA测序(miRNA-seq)
小RNA测序技术采用胶分离技术，收集样品中18-30nt的RNA片段，利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息